Paraf Asisten
|
LAPORAN
PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK
Judul : Penggunaan Software Kimia Dalam Penggambaran Struktur Molekul
Tujuan Percobaan : Mempelajari dan mengaplikasikan pengetahuan dan
keterampilan menggambar struktur molekul senyawa kimia menggunakan software ChemSketch.
Pendahuluan
Era modern ini
merupakan era dimana terjadinya kemajuan teknologi didunia. Kemajuan
teknologi tersebut terjadi diberbagai bidang yaitu elektronik, kedokteran,
pertanian, sains dan lain-lain. Kemajuan ini juga berpengaruh terhadap ilmu
kimia baik peralatannya yang canggih maupun software yang digunakan. Software
kimia diciptakan untuk mempermudah dalam mempelajari ilmu kimia. ChemSketch
adalah salah satu contoh software kimia yang sangat bermanfaat bagi siswa ataupun
mahasiswa yang menekuni ilmu kimia karena pada dasarnya pembelajaran secara
langsung atau praktek lebih mudah dimengerti dan dipahami daripada penjelasan
dengan lisan.
Praktek-praktek di laboratorium kimia saat
ini akan menghadapi kendala ketersediaan bahan kimia yang relatif mahal yaitu
tidak semua laboratorium kimia di Indonesia dapat menyediakan fasilitas
laboratorium kimia yang memadai untuk keperluan tersebut. Sekolah tidak mampu menyelenggarakan
kegiatan praktek dilaboratorium kimia secara representatif. Sekolah-sekolah
sebagian besar memiliki fasilitas untuk praktek komputer bagi para siswa.
Fasilitas komputer yang ada tersebut dapat dimanfaatkan sebagai alternatif
untuk keperluan praktek pembelajaran ilmu kimia. Contohnya adalah pembahasan
tentang ukuran atom dan perioditasnya, bentuk geometri dari struktur molekul,
stereokimia dan lain-lain. Struktur molekul tersebut dapat divisualisasikan
dengan software ChemSketch. Pengenalan dan penggunaan software ini diperlukan
untuk meningkatkan pemahaman terhadap struktur molekul (Tahir, 2003).
Model molekul pada mulanya diajarkan dengan
menggunakan model tiga dimensional yaitu dengan menggunakan alat peraga yang
berbentuk bola-bola dari bahan plastik atau kayu. Perkembangan teknologi
komputer pada saat ini baik dari segi perangkat keras maupun
perangkat lunak memungkinkan untuk pemodelan molekul dengan menggunakan
komputer. Perangkat lunak yang tersedia di pasaran saat ini dapat digunakan
untuk keperluaan visualisasi model molekul (Tahir, 2003).
Chemsketch adalah software yang digunakan untuk menggambarkan dan
memodelkan struktur molekul kimia. Software chemsketch dapat menggambarkan
struktur kimia dalam bentuk 2D dan 3D. Software ini sangat mudah digunakan
hanya dengan mengklik dan mendrag tool-tool yang tersedia untuk menggambar
struktur yang diinginkan. Program ini juga menyediakan struktur asam amino,
alkaloid, karbohidrat, asam nukleat, DNA/RNA, peralatan laboratorium yang
berupa gelas, orbital, steroid, terpen dan lain-lain yang tersimpan dalam menu
templates. Software ini juga menyediakan penggambaran kurva dan grafik.
Chemsketch dikeluarkan oleh ACD/Labs.com yang dapat diunduh secara gratis
(Anonim, 2008).
Cara
menjalankan software ChemSketch serupa dengan menjalankan program-program
lain pada komputer, akan tetapi terlebih dahulu harus
menginstall sofware ChemSketch. Cara memulai program ChemSketch yang telah
terinstall yaitu dari menu windows klik start, lalu klik program, pilih ACDLABS 11.0 dan
kemudian pilih ChemSketch maka jendela program ChemSketch akan terbuka (Martoprawiro, 2008).
Menggambar bentuk molekul dalam bentuk 3D
(misalkan molekul CH4) dapat dilakukan rotasi untuk memberikan
gambaran yang utuh dapat dilakukan dengan cara berikut:
1.
Buka aplikasi Chemsketch yang
telah terinstall
3. Klik Atom C pada Mode Structure yang
ada di tool kiri dan klik sekali pada area kerja hingga menghasilkan rumus
molekul CH4. Add explicite hydrogen dari menu Tools untuk membuat
bentangan rumus struktur, seleksi rumus struktur, klik menu Tools dan pilih
Strucutre Properties maka akan muncul menu pop up dan pada tab Common beri
centang All Show Carbons
4. Optimisasi struktur 3D
dengan cara klik menu Tools kemudian klik 3D structure optimization, jika ada
pilihan (klik yes untuk menghilangkan atom H saat optimisasi 3D-nya), setelah itu buka 3D Viewer Acd Lab dari Start
menu
5.
Kembali ke Chemsketch
2D untuk mengkopi 2D ke 3D
6. Merotasi untuk dapat menunjukkan berbagai
properties bentuk molekul seperti panjang ikatan dan sudut yang dibentuk oleh
3 buah atom dengan ChemSketch ini (Martoprawiro, 2008).
Prinsip Kerja
Prinsip kerja
program chemsketch yaitu membuat dan menggambar struktur molekul kimia dalam
bentuk 2D maupun 3D dengan menyediakan berbagai macam warna yang dapat
digunakan untuk memudahkan memahami struktur molekul yang akan digambar.
Alat
Laptop atau
PC dan aplikasi ACD ChemSketch
lihat selengkapnya dibawah ini.
|